Голубой мир, символизирующий разум, непрерывно подвергается атакам существ, называемых Найтфлай О'Ноут, — пришельцев из Алого мира, олицетворяющего инстинкт.
Акира Асаги, семнадцатилетняя главная героиня и исследовательница Голубого мира, назначена возглавить оборону на Рюкю ЛАГ — гордости оборонительных сооружений на островах Исигаки и Ириомоте. Там она знакомится с шестым боевым отрядом «IS», сформированным спустя четыре года после жестокой битвы, уничтожившей пятый отряд.
Акире предстоит вести за собой шестерых всадников — Всадников «Скаред Зекс» — на войну с другим миром, одновременно выстраивая с ними всё более тесные отношения.
