История рассказывает об Аптекаре, путешествующем по феодальной Японии. Занимается он не столько торговлей, сколько борьбой с мононокэ, разгневанными духами.
Единственным способом борьбы с мононокэ является необычный клинок Аптекаря, для применения которого необходимо сперва раскрыть «Форму» мононокэ, затем узнать «Суть» произошедших ранее событий и наконец понять «Причину» того, зачем пришел дух. И лишь после выполнения трёх этих условий страдающего мононокэ возможно будет освободить.