После отчаянного бегства из Музея памяти Саяка Мики возвращается в город Митакихара с тревожными новостями. Не в силах смириться с тем, что ей открылось, Саяка рассказывает Мадоке Мадока Канамэ и Хомуре Хомура Акэми, где искать Мами Томоэ, — но, что куда важнее, раскрывает пугающую правду о самой природе волшебниц. Прекрасно понимая, какая жестокая судьба ждёт их впереди, три подруги без колебаний решают действовать вместе и наконец спасти Мами.В это же время в городе Камихама Ячиё Нанами охотится за различными «слухами», пытаясь отыскать отель «Фендт Хоуп» — штаб организации «Крылья Магиуса». Эта таинственная группировка волшебниц — единственная ниточка, способная привести Ячиё к Ирохе Тамаки, чьё исчезновение до сих пор остаётся загадкой. Твёрдо решив вновь собрать команду «Вилла Микадзуки», Ячиё клянётся уничтожить «Крылья Магиуса» и положить конец их зловещим замыслам.Пока разворачиваются эти неспокойные события, миру угрожает новая, куда более страшная опасность, способная поставить на грань катастрофы всё сущее.